يتمتع صندوق دعم الطلبة بالاستقلال الإداري والمالي ومقره في الجامعة، ويتبع مجلس الأمناء ويشرف عليه مجلس إدارة، وتنظم عمله لائحة تنفيذية صادرة عن مجلس إدارة الصندوق. وحُدِّدَ الشكل الإداري للصندوق كما يلي:
أولا : خلال المرحلة الاولى من تأسيس الصندوق في العام 2014/2015 م فقد كان التشكيل الإداري للصندوق كالتالي :
مجلس إدارة الصندوق : ويتكون من كل من :
| نائب رئيس رئيس مجلس الأمناء | رئيسا |
| رئيس الجامعة | نائبا للرئيس |
| مساعد رئيس الجامعة للشؤون الإدارية والمالية | عضو |
| مدير دائرة شؤون الطلبة | عضو |
| مدير الصندوق | عضو |
| اثنين من المساهمين الرئيسيين في الصندوق | أعضاء |
اللجنة التنفيذية للصندوق :
| رئيس الجامعة | رئيسًا |
| مساعد رئيس الجامعة للشؤون الإدارية والمالية | نائبا للرئيس |
| مدير دائرة شؤون الطلبة | عضو |
| مدير الصندوق | عضو |
| رئيس قسم الإرشاد الطلابي | عضو ومقرر |
ثانيا : في العام الدراسي 2019 / 2020 .. ارتأت إدارة الصندوق أن يتم إشراك المجتمع في عضوية الصندوق بما يضفي نوع من الشفافية ويطور أعمال الصندوق ويتيح له الفرصة في التعاون مع مؤسسات المجتمع الاهلية بما فيه الفرق الأهلية الخيرية .. ولذلك فقد تم إعادة التشكيل الإداري للصندوق كالتالي :
مجلس إدارة الصندوق :
| رئيس مجلس الأمناء | رئيسا |
| عضو من مجلس الأمناء | نائبا للرئيس |
| اثنين من الداعمين الرئيسيين في الصندوق | أعضاء |
| ثلاثة أعضاء من المجتمع المحلي | أعضاء |
| رئيس اللجنة التنفيذية للصندوق | عضوا |
| رئيس المجلس الاستشاري الطلابي بالجامعة | عضوا |
| مدير الصندوق | عضوًا ومقررا |
اللجنة التنفيذية للصندوق :
| نائب رئيس الجامعة للموارد والدعم المؤسسي | رئيسًا |
| مدير دائرة شؤون الطلبة | نائبا للرئيس |
| ثلاثة أعضاء من المجتمع المحلي | أعضاء |
| نائب رئيس المجلس الاستشاري الطلابي | عضوًا |
| مدير الصندوق | عضوًا ومقررا |